執行 WRF 出現套件問題

WRF
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助教好:
在嘗試以 SLURM 送出工作時，
會出現

mpiexec: error while loading shared libraries: libnvidia-ml.so.1: cannot open shared object file: No such file or directory

的錯誤，以下是使用的 script 內容:

#!/bin/bash -l
#SBATCH -N 4
#SBATCH --ntasks-per-node=40
#SBATCH --cpus-per-task=1
#SBATCH -J wrf1Dom
#SBATCH -t 0:30:00
#SBATCH --exclusive
#SBATCH -d singleton
#SBATCH -o wrfPrac-%j.out
#SBATCH --account=ACD112218  # Add your account name here

module purge
module load compiler/gcc/7.5.0
module load zlib-1.2.11-t
module load mpich-3.1.4-t
module load hdf5-1.8.21-t
module load pnetcdf-1.12.0-t
module load netcdf-c-4.7.3-t

module list

export OMP_NUM_THREADS=1
# export LD_LIBRARY_PATH=/home/u5051285/wrf/opt/mpich-3.1.4/lib:$LD_LIBRARY_PATH
export MPIR_CVAR_ENABLE_GPU=0


ln -sf namelist.input-VALIDATE namelist.input
/usr/bin/time -p mpiexec -np 160 ./wrf.exe
mkdir VALIDATE
mv rsl.* namelist.input namelist.output VALIDATE
mv wrfo* VALIDATE


ln -sf namelist.input-TIMING namelist.input
/usr/bin/time -p mpiexec -np 160 ./wrf.exe
mkdir TIMING
mv rsl.* namelist.input namelist.output TIMING

針對 libnvidia.so 該 lib，並沒有在其他地方被搜尋到

有嘗試的一個做法是:
export MPIR_CVAR_ENABLE_GPU=0
是根據 mpich.org/static/downloads/4.0.1/mpich-4.0.1-README.txt 中 GPU support 的部分，嘗試關掉 cuda 相關的支援，但沒有解決問題
希望助教能協助指出可能哪邊有錯誤
若有需要，我再將指令寄去助教信箱中給你們參考
謝謝!

2

同學好，

我實在很難想像為什麼會編譯出需要 CUDA library 的程式 OwO

error while loading shared libraries 這個錯誤訊息是由 linker 印出的。在程式啟動前，linker 就要將所有 shared libraries 找到並載入記憶體，才會開始執行程式。因此，沒辦法使用環境變數在 runtime 時避免這個問題，必須要重新編譯。

可以在 configure 的時候加 --without-cuda 這個參數看看

3

助教好:
謝謝助教回覆，我懷疑是載點不乾淨@@
會再用不同方法測試，謝謝!